植物水溶性蔗糖合成酶生物信息学分析初探

韩立敏 王喆之*
陕西师范大学生命科学学院,西安710062

通信作者:王喆之;E-mail: zzwang@snnu.edu.cn;Tel: 029-85308317

摘 要:

用生物信息学方法对已在 GenBank 上注册的黑麦草、绿竹、菜豆、马铃薯、颤杨等植物水溶性蔗糖合成酶基因的 核苷酸序列以及推导的氨基酸序列、组成成分、氨基酸翻译后修饰、导肽、跨膜拓朴结构域、疏水性 / 亲水性、蛋白质二 级结构以及功能结构域等进行分析预测和推断的结果表明,这些植物的水溶性蔗糖合成酶位于线粒体中,是非跨膜的亲 水性蛋白,a- 螺旋和不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,b- 转角和延伸链散布于整个蛋白质中,包含 2 个 功能结构域,即蔗糖合成功能域和糖基化合物转移功能域。

关键词:蔗糖合成酶; 水溶性;生物信息学

收稿:2006-06-06   修定:2006-09-21

植物水溶性蔗糖合成酶生物信息学分析初探

韩立敏 王喆之*
陕西师范大学生命科学学院,西安710062

Corresponding author: ; E-mail: zzwang@snnu.edu.cn; Tel: 029-85308317

Abstract:

用生物信息学方法对已在 GenBank 上注册的黑麦草、绿竹、菜豆、马铃薯、颤杨等植物水溶性蔗糖合成酶基因的 核苷酸序列以及推导的氨基酸序列、组成成分、氨基酸翻译后修饰、导肽、跨膜拓朴结构域、疏水性 / 亲水性、蛋白质二 级结构以及功能结构域等进行分析预测和推断的结果表明,这些植物的水溶性蔗糖合成酶位于线粒体中,是非跨膜的亲 水性蛋白,a- 螺旋和不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,b- 转角和延伸链散布于整个蛋白质中,包含 2 个 功能结构域,即蔗糖合成功能域和糖基化合物转移功能域。

Key words: 蔗糖合成酶; 水溶性;生物信息学

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